Guía fiscal · Actualizada junio 2026

Obligaciones fiscales del fisioterapeuta autónomo en España

IRPF, IVA, modelos trimestrales, gastos deducibles, libros contables y Verifactu. Todo lo que necesitas cumplir y cómo hacerlo sin agobios.

📌 Aviso Esta guía tiene carácter informativo general. Para tu situación concreta, consulta siempre con un asesor fiscal o gestor. La legislación fiscal puede cambiar.

Alta de actividad: lo primero que debes hacer

Antes de emitir tu primera factura, debes darte de alta como autónomo. El proceso tiene dos partes:

1. Alta en la AEAT (Hacienda)

Presentar el Modelo 036 o 037 indicando el inicio de actividad. El epígrafe del IAE para fisioterapia es el 843 — Otros profesionales sanitarios. Este trámite es gratuito y se puede hacer online con certificado digital.

2. Alta en la Seguridad Social (RETA)

Darse de alta en el Régimen Especial de Trabajadores Autónomos antes de iniciar la actividad. Desde 2023 las cuotas son por tramos según ingresos reales, desde ~230€/mes hasta ~530€/mes.

Además, si eres fisioterapeuta, debes estar colegiado activamente en el Colegio Oficial de Fisioterapeutas de tu comunidad para ejercer de forma legal.

IRPF: cómo tributa un fisio autónomo

Los fisioterapeutas autónomos tributan en el IRPF generalmente en estimación directa simplificada, que es el método más habitual para profesionales con facturación moderada.

¿Qué se paga?

El rendimiento neto de la actividad: ingresos menos gastos deducibles. El tipo progresivo va del 19% al 47% según el tramo de ingresos.

¿Cuándo se paga?

Trimestralmente mediante el Modelo 130 (pagos a cuenta) y anualmente en la declaración de la Renta (Modelo 100).

¿Cuánto se paga trimestralmente?

El 20% del rendimiento neto acumulado desde el inicio del año, menos los pagos fraccionados ya realizados en trimestres anteriores.

¿Y si mis clientes me retienen?

Algunos clientes (mutuas, empresas) retienen el 15% de IRPF en cada factura. En ese caso puedes quedar exonerado de presentar el Modelo 130 si más del 70% de tus ingresos tienen retención.

IVA: exento o no según el servicio

Este es uno de los aspectos que más confunde a los fisioterapeutas. La regla es simple pero importante:

✅ Exento de IVA

Servicios sanitarios con finalidad terapéutica o rehabilitadora prestados por profesional sanitario colegiado. Artículo 20.1.3 LIVA.

  • Fisioterapia por lesión o patología
  • Rehabilitación postoperatoria
  • Tratamiento del suelo pélvico
  • Fisioterapia respiratoria
  • Fisioterapia neurológica

❌ Con IVA 21%

Servicios de bienestar, relajación o estética sin prescripción médica ni finalidad terapéutica demostrable.

  • Masajes de relajación sin patología
  • Tratamientos estéticos
  • Servicios de wellness o spa
  • Formación y cursos (salvo exención educativa)
📌 Si tienes servicios con y sin IVA Deberás presentar el Modelo 303 trimestralmente por los servicios sujetos a IVA y llevar un registro separado de ambos tipos de facturas. Consulta con tu gestor la forma más adecuada de organizarlo.

Calendario de declaraciones trimestrales

Como autónomo debes presentar estas declaraciones en los primeros 20 días de los meses indicados:

1er trimestre (enero-marzo)
📅 Del 1 al 20 de abril
Modelo 130 — IRPF Modelo 303 — IVA (si aplica)
2º trimestre (abril-junio)
📅 Del 1 al 20 de julio
Modelo 130 — IRPF Modelo 303 — IVA (si aplica)
3er trimestre (julio-septiembre)
📅 Del 1 al 20 de octubre
Modelo 130 — IRPF Modelo 303 — IVA (si aplica)
4º trimestre (octubre-diciembre)
📅 Del 1 al 20 de enero
Modelo 130 — IRPF Modelo 303 — IVA (si aplica) + Modelo 390 (resumen anual IVA)

Además, cada año en abril-junio presentas la declaración de la Renta (Modelo 100).

Gastos deducibles del fisioterapeuta autónomo

Deducir correctamente tus gastos puede reducir significativamente tu factura fiscal. Estos son los principales gastos que puedes deducir como fisioterapeuta autónomo:

💰 Cuota de autónomos

La cuota mensual del RETA es 100% deducible como gasto de la actividad.

🏠 Local y suministros

Alquiler de consulta, luz, agua, internet y teléfono. Si trabajas desde casa, solo la parte proporcional al espacio dedicado a la actividad (con condiciones legales estrictas).

🛏️ Material clínico

Camillas, electroterapia, material de cura y tratamiento. Los bienes de inversión (valor superior a 300€) se amortizan en varios años.

💻 Software de gestión

La suscripción mensual al software de gestión clínica y facturación es un gasto deducible al 100% por ser necesario para el ejercicio de la actividad.

🛡️ Seguro RC profesional

El seguro de responsabilidad civil profesional, obligatorio para colegiados, es deducible al 100%.

📚 Formación

Cursos, congresos, libros y formación continua relacionada con la actividad profesional son deducibles.

🏥 Colegiación

La cuota del colegio de fisioterapeutas es deducible como gasto profesional necesario para el ejercicio de la actividad.

📊 Gestoría y asesoría

Los honorarios de tu gestor o asesor fiscal son deducibles. Un gestor de 50-100€/mes puede ahorrarte mucho más en impuestos.

📌 Regla de oro Para que un gasto sea deducible debe estar relacionado directamente con la actividad, estar pagado y justificado con factura o ticket, y estar registrado en tus libros contables. Sin justificante, no se deduce.

Libros contables obligatorios

En estimación directa simplificada, debes llevar estos registros:

📗
Libro registro de ventas e ingresos

Registra todas las facturas emitidas: número, fecha, cliente, base imponible y tipo de IVA o mención de exención.

📘
Libro registro de compras y gastos

Registra todas las facturas recibidas y gastos de la actividad: fecha, proveedor, concepto e importe.

📙
Libro registro de bienes de inversión

Solo si tienes bienes amortizables (camillas, equipos de electroterapia, etc.). Registra fecha de compra, precio y vida útil.

Un buen software de gestión clínica genera automáticamente estos registros a partir de las facturas que emites y los gastos que introduces.

Verifactu: la nueva obligación desde 2027

A las obligaciones fiscales existentes se suma Verifactu: la obligación de usar software homologado que genere facturas con hash SHA-256 y código QR desde el 1 de julio de 2027 para autónomos.

No cumplir con Verifactu puede suponer sanciones de hasta 50.000€ por ejercicio fiscal, independientemente de si tus facturas llevan IVA o están exentas.

Software para gestionar tus obligaciones fiscales

Un buen software de facturación automatiza gran parte de tus obligaciones fiscales: genera los libros contables automáticamente, calcula los pagos fraccionados del Modelo 130 y, desde 2027, cumple con Verifactu.

Para un fisioterapeuta autónomo hay dos tipos de solución:

Solo facturación y contabilidad

Si ya tienes resuelta la agenda clínica y solo necesitas la parte fiscal.

Gestión clínica + facturación

Si quieres todo en una sola herramienta: agenda, historial y facturas.

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Preguntas frecuentes

¿Qué impuestos paga un fisioterapeuta autónomo?

Los principales son el IRPF (trimestralmente con el Modelo 130 y anualmente en la Renta) y el IVA solo si tiene servicios sujetos a IVA. Los servicios terapéuticos de fisioterapia están exentos de IVA.

¿Qué gastos puede deducirse un fisioterapeuta autónomo?

Los principales: cuota de autónomos, alquiler de consulta, material clínico, software de gestión, seguro de RC, colegiación, formación y gestoría. Siempre con factura justificativa y registrado en los libros contables.

¿Tiene que darse de alta en el IAE un fisioterapeuta?

Sí, mediante el Modelo 036 o 037 antes de iniciar la actividad. El epígrafe es el 843. Los autónomos con facturación inferior a 1.000.000€ no pagan la cuota del IAE.

¿Qué libros contables debe llevar un fisioterapeuta?

En estimación directa simplificada: libro de ventas e ingresos, libro de compras y gastos, y libro de bienes de inversión si tiene activos amortizables. Un buen software de gestión los genera automáticamente.

¿Necesito contratar un gestor o puedo hacerlo solo?

Legalmente puedes gestionarlo solo. En la práctica, para muchos fisioterapeutas autónomos un gestor de 50-100€/mes es una inversión que se amortiza en tiempo ahorrado y en deducciones que podrías perderte sin asesoramiento experto.

¿Ya tienes el software fiscal adecuado?

Elige un programa compatible con Verifactu que automatice tus libros contables y tus declaraciones trimestrales.